- Amiloidosis
- Bioseñales en Terapia Intensiva
- Desarrollo e Innovación en Neuromodulación
- Educación en Ingeniería Biomédica
- Epidemiología Global
- Hipertensión Arterial
- Informática en Salud
- Ingeniería Biomédica
- Investigación Biomolecular en Enfermedades Infecciosas
- Investigación en Fisiología y Fisiopatología Renal
- Investigación Traslacional en Hepatología
- Investigación Traslacional en Microbioma
- Laboratorio de Nichos Celulares Patológicos y de Ingeniería de Tejidos
- Medicina de Precisión
- Medicina Traslacional en Diabetes y Trasplante
- Neoplasia Endocrina Múltiple
- Pro.Can.He. (Programa de Cáncer Hereditario)
Investigación Traslacional en Microbioma
Director del grupo
Integrantes
Basbus, Luis Roberto
Cabanas, Sofía (Servicio Gastroenterología)
Cajal, Andrea Romina (Personal Técnico Apoyo IMTIB)
Campana, Juan (Servicio Cirugía HIBA)
Dádamo, Maximiliano Hernán (CPA IMTIB)
Diaz, María de las Nieves (Servicio Anatomía Patológica, HIBA)
Ferro, Fabiana Alejandra (HIBA)
Herrera, Lucía Manuela (CPA IMTIB)
Lohmann, Florencia Adriana (becaria doctoral IUHI)
Loresi, Monica Alejandra (CPA IMTIB)
Mazza, Malena (Servicio Anatomía Patológica)
Mentz, Ricardo (Servicio Cirugía HIBA)
Rossi, Gustavo (Servicio Cirugía HIBA)
Sanchez, Florencia (Servicio Anatomía Patológica)
Santino, Juan Pablo (Servicio Anatomía Patológica HIBA)
Slullitel, Pablo (Servicio Ortopedia y Traumatología)
Soto, Laura (CPA IMTIB)
Specterman, Martín (becario doctoral IUHI)
– Investigación traslacional de Microbioma (InTraMic).
Análisis del microbioma intestinal humano: caracterización taxonómica en distintos contextos clínicos de alta prevalencia.
- Adenocarcinoma colorrectal (CRC).
- Trasplante alogénico de células madres hematopoyéticas.
- Enfermedad de hígado graso no alcohólico.(Línea a cargo de Julieta Trinks) CONICET: SUBSiDIO PUE 2019
Los objetivos de este proyecto se centran en la caracterización del microbioma fecal a través del análisis metagenómico y molecular a fin de identificar potenciales biomarcadores que sean aplicables en diferentes contextos clínicos (oncológicos, metabólicos e inmunológicos) transferibles al sistema sanitario.
– Red internacional de Microbioma y OPTIMISTICC: Red liderada por Leeds Institute of Medical Research Division of Pathology and Data Analytics and the Pathology Colorectal Cancer Group, Section of Pathology and Tumour Biology, St James’s University Hospital, Leeds University. Esta red está conformada por instituciones de países con diferentes incidencias de cáncer colorrectal. Incluye países del Sudeste Asiático, Latinoamérica, África y Europa. El objetivo es conocer los factores asociados al microbioma que promueven y afectan el desarrollo y evolución del cáncer colorrectal en estos países.
– Caracterización taxonómica del microbioma de cadera: Este proyecto se centra en el estudio del rol que cumple la microbiota de la cadera en pacientes con osteoartritis de cadera y fractura del cuello del fémur. Proyecto subsidiado por el 2021 SICOT Research Grant (Société Internationale de Chirurgie Orthopédique et de Traumatologie).
– Microbioma en pacientes de riesgo: Interrogar el papel del microbioma durante el desarrollo del cáncer colorrectal, particularmente en aquellos individuos con riesgo familiar o esporádico asociado al desarrollo de cáncer colorrectal. Colaboración con la John Hopkins University.
– MUTOGRAPHS: Con el objetivo final de desarrollar mejores programas de prevención, detección temprana y nuevos tratamientos contra el cáncer, este proyecto ha creado un consorcio de científicos de distintos países del mundo. A través de este proyecto se ha logrado crear uno de los biorrepositorios más diversos y completos que existen para investigar las causas de ocho tipos de cánceres, que presentan diferentes incidencias en el mundo. Cuenta con distintos tipos de muestras biológicas, que incluyen tejidos tumorales, tejidos sanos, sangre, plasma, saliva y orina, al igual que datos demográficos y otros factores de riesgo asociados al cáncer como el consumo de alcohol, tabaco, sobrepeso/obesidad, ciertas condiciones médicas y antecedentes familiares, entre otras variables y su análisis involucra la huella mutacional generada por la microbiota. Las muestras incluidas en este proyecto provienen de pacientes con cáncer esofágico, renal, colorrectal, unión gastroesofágica y páncreas. Mutographs es liderado entre otros centros, por el Genetic Cancer Susceptibility Group International Agency for Research Cancer (IARC, OMS) y el Wellcome Sanger Institute, Cancer UK.
– PROMINENT: Basado en muestras y datos recopilados en Mutographs, con el fin de caracterizar a nivel molecular y genómico el tejido normal, este proyecto intenta desarrollar una hoja de ruta describiendo los procesos moleculares y genéticos que promueven a partir de células normales portadoras de mutaciones impulsoras hasta la progresión tumoral maligna. Este proyecto es liderado por Allan Balmain (University of California, San Francisco) y Paul Brennan (International Agency for Research on Cancer (IARC).
– Investigando mutaciones clonales en pacientes con CCR de Argentina versus Reino Unido: Proyecto colaborativo en el marco del Proyecto OPTIMISTICC. Este proyecto se centra en el estudio y caracterización de las mutaciones clonales de la mucosa colorrectal y se lleva a cabo en conjunto con el Leeds Institute of Medical Research Division of Pathology and Data Analytics and the Pathology Colorectal Cancer Group, Section of Pathology and Tumour Biology, St James’s University Hospital, Leeds University.
El microbioma intestinal (MBI) actúa como barrera defensiva contra infecciones y participa en procesos protectores, estructurales y metabólicos del epitelio intestinal, impactando la salud y la enfermedad.
Inicialmente centrado en enfermedades gastrointestinales, el estudio del MBI se ha expandido a enfermedades metabólicas (ej. hígado graso no alcohólico), inmunológicas (ej. trasplante alogénico de células progenitoras hematopoyéticas), inflamatorias, autoinmunes, cardiovasculares, diabetes, obesidad y trastornos neuropsiquiátricos como el autismo y la depresión.
Por otra parte, en relación al cáncer colorrectal (CCR), tercer cáncer más frecuente en nuestro país, estudios recientes del microbioma fecal en CCR han mostrado asociaciones con factores de riesgo como edad, hábitos alimentarios y estilo de vida. En las últimas décadas, ha habido un preocupante incremento en la incidencia de cáncer colorrectal entre la población menor de 50 años. Este fenómeno ha desafiado las percepciones tradicionales de que el cáncer colorrectal afecta principalmente a adultos mayores. Factores como cambios en los estilos de vida, incluyendo dietas menos saludables, falta de ejercicio y posibles influencias ambientales, podrían estar contribuyendo a este aumento en la incidencia entre los adultos jóvenes. El aumento alarmante en la incidencia de cáncer colorrectal entre la población menor de 50 años subraya la importancia crítica de identificar las variables que promueven esta tendencia. Mediante el estudio exhaustivo de factores como cambios en la dieta, estilo de vida sedentario, exposiciones ambientales y posibles predisposiciones genéticas, podemos avanzar en la identificación de nuevos biomarcadores tempranos. Estos biomarcadores no solo podrían permitir una detección más precoz del cáncer colorrectal esporádico, sino también abrir nuevas oportunidades para intervenciones preventivas efectivas que reduzcan su impacto en la población joven. El estudio del microbioma también se ha vinculado al cáncer colorrectal esporádico, explorando cómo las comunidades microbianas intestinales pueden influir en el desarrollo de esta enfermedad. La investigación sugiere que cambios en la composición y función del microbioma podrían ser un factor contribuyente en la carcinogénesis colorrectal, ofreciendo así nuevas vías para identificar biomarcadores precoces y desarrollar estrategias preventivas más precisas y efectivas.
Por otra parte, el MBI puede ser modificado mediante intervenciones dietéticas y el uso de prebióticos y probióticos, presentando alternativas de fácil implementación para la prevención y tratamiento de enfermedades.
En la actualidad, los avances metodológicos nos permiten identificar nuevos biomarcadores pronósticos y predictivos, cruciales para el diagnóstico temprano y la personalización de tratamientos, ofreciendo nuevas modalidades terapéuticas. El análisis del microbioma ha evolucionado significativamente con el desarrollo de las metodologías multiómicas que permiten un entendimiento más profundo de las comunidades microbianas y su impacto en la salud y la enfermedad. El abordaje multiómico nos brinda información profunda tanto a nivel del metagenoma, metatranscriptoma, como del metaboloma, permitiéndonos conocer qué microorganismos están implicados, qué genes están expresando y cuáles son los metabolitos por ellos producidos respectivamente.
Estos desarrollos representan un avance significativo hacia la medicina personalizada, mejorando la salud pública global con herramientas innovadoras para la gestión de la salud a nivel individual y poblacional.
– Florencia Adriana Lohmann, Martín Isac Specterman Zabala, Julieta Natalia Soarez, Maximiliano Dádamo, Mónica Alejandra Loresi, María de las Nieves Diaz, Walter Hernán Pavicic, Marcela Fabiana Bolontrade, Marcelo Raúl Risk, Juan Pablo Santino, Carlos Alberto Vaccaro & Tamara Alejandra Piñero (2025). Artificial Intelligence-Based Quantification and Prognostic Assessment of CD3, CD8, CD146, and PDGF-Rβ Biomarkers in Sporadic Colorectal Cancer. In: Florez, H., Astudillo, H. (eds) Applied Informatics. ICAI 2024. Communications in Computer and Information Science, vol 2236. Springer, Cham. https://doi.org/10.1007/978-3-031-75144-8_1
– Perdomo S, Abedi-Ardekani B, et al. The Mutographs biorepository: A unique genomic resource to study cancer around the world. Cell Genom. 2024 Mar 13;4(3):100500. doi: 10.1016/j.xgen.2024.100500. Epub 2024 Feb 6. PMID: 38325367; PMCID: PMC10943582.
– Bose M, Wood HM, Young C; International C. R. C. Microbiome Network (AMS/CRUK); Quirke P, Seshadri RA. Analysis of an Indian colorectal cancer faecal microbiome collection demonstrates universal colorectal cancer-associated patterns, but closest correlation with other Indian cohorts. BMC Microbiol. 2023 Mar 2;23(1):52. doi:10.1186/s12866-023-02805-0
– Young C, Wood HM, Seshadri RA, Van Nang P, Vaccaro C, Melendez LC, Bose M, Van Doi M, Piñero TA, Valladares CT, Arguero J, Balaguer AF, Thompson KN, Yan Y, Huttenhower C, Quirke P. The colorectal cancer-associated faecal microbiome of developing countries resembles that of developed countries. Genome Med. 2021 Feb 16;13(1):27. doi: 10.1186/s13073-021-00844-8
– Burgos, V., Piñero, T., Fernández, M.L., Risk, M. (2021) A Complementary Approach in the Analysis of the Human Gut Microbiome Applying Self-organizing Maps and Random Forest. In: Florez, H., Pollo-Cattaneo, M.F. (eds) Applied Informatics. ICAI 2021. Communications in Computer and Information Science, vol 1455. Springer, Cham. doi:10.1007/978-3-030-89654-6_8
– Piñero TA, Soukarieh O, Rolain M, Alvarez K, López-Köstner F, Torrezan GT, Carraro DM, De Oliveira Nascimento IL, Bomfim TF, Machado-Lopes TMB, Freitas JC, Toralles MB, Sandes KA, Rossi BM, Junior SA, Meira J, Dominguez-Valentin M, Møller P, Vaccaro CA, Martins A, Pavicic WH. MLH1 intronic variants mapping to + 5 position of splice donor sites lead to deleterious effects on RNA splicing. Fam Cancer. 2020 Oct;19(4):323-336. doi: 10.1007/s10689-020-00182-5
– Metagenomic comparative analysis of fecal samples from colorectal cancer patients from Argentina. Mayordomo, Andrea Constanza; Wood, Henry M.; Young, Caroline; Arguero, M.Julieta; Balaguer, Alba Fuentes; Burgos, Valeria; Etcheverry, Josefina Fuhr; Pavicic, Walter Hernán; Risk, Marcelo; Quirke, Phil; Vaccaro C.A.; Piñero T.A. Argentina. Buenos Aires. 2021. Libro. Resumen. Conferencia. 2nd Women in Bioinformatics & Data Science LA Conference Fostering collaboration among women. Women Bioinformatics Network LA
-A Pilot Case-Control Study: Microbiome Analysis of Fecal Samples of Colorectal Cancer Patients from Chile and Argentina. Mayordomo, Andrea Constanza; Valladares, Camilo Tapia; Wood, Henry M.; Young, Caroline; Arguero, M.Julieta; Balaguer, Alba Fuentes; Pavicic, Walter Hernán; Risk, Marcelo; Quirke, Phil; Melendez, Luis Contreras; Vaccaro C.A., Piñero T.A. Argentina. Buenos Aires. 2021. Congreso. XVIII Congreso Latinoamericano de Genética LIV Reunión Anual de la Sociedad de Genética de Chile XLIX Congreso Argentino de Genética VIII Congreso de la Sociedad Uruguaya de Genética I Congreso Paraguayo de Genética V Congreso Latinoamericano de Genética. Asociación Latinoamericana de Genética
– Complementary approach in the analysis of the human gut microbiome applying Self-Organizing Maps and Random Forest. Burgos, Valeria; Piñero, Tamara A.; Fernández, María Laura. Argentina. Buenos Aires. 2021. Libro. Artículo Completo. Conferencia. ICAI 2021 Fourth International Conference on Applied Informatics. Universidad Tecnológica Nacional Facultad Regional Buenos Aires
– Preliminary evaluation through the Gradient Boosting Algorithm (GBM) of CD146 overexpression in sporadic colorectal cancer patients. Florencia Adriana Lohmann, Pamela Rosalez, Mónica Alejandra Loresi, Maximiliano Hernán Dádamo, Laura Raquel Soto, Julieta Natalia Soarez, Walter Hernán Pavicic, Andrea Romina
Cajal, Juan Pablo Santino, Marcelo Raúl Risk, Carlos Alberto Vaccaro, Tamara Alejandra Piñero. Reunión Anual de Sociedades de Biociencia. 2023
– Preliminary GBM analysis of CD146, PDGF-Rβ, CD3, CD8 in Argentina’s CRC cohort to correlate with clinicopathological and epidemiological data. Mercedes Juarez Araoz*, Florencia A. Lohmann*,Mónica A. Loresi, Maximiliano H. Dádamo, Julieta N. Soarez, Walter H. Pavicic, Caroline Young, Marcela F. Bolontrade, Marcelo R. Risk, Juan P. Santino, Carlos A. Vaccaro, Tamara A. Piñero. Sheffield Pathology. Pathological Society of Great Britain and Ireland. 2024
– Genetic Cancer Susceptibility Group International Agency for Research Cancer (IARC, OMS).
– Cancer UK
– Grand Challenges CRUK OPTIMISTICC (2020-2025)
– Grand Challenges CRUK MUTOGRAPHS (2018-2024)
– Grand Challenges CRUK PROMINENT (2022-2026)
– SICOT Research Grant (Société Internationale de Chirurgie Orthopédique et de Traumatologie). (2021)